沉水植物种类丰富，形态多姿多彩。植物水族馆共展示了26个科300多种沉水植物，游人可直观地欣赏奇妙的水下植物世界。37个大型展示箱组成亚洲水草区、非洲水草区、大洋洲水草区、美洲水草区和欧洲水草区等5个区域，依不同水域和生境特点营造水下景观，构思巧妙，令人赞叹。

热带雨林室高27.4 m，占地面积7987m2。1000多种热带植物来自世界各地，姿态万千、色彩缤纷，营造了雨林奇观区、水生植物区、奇趣植物区、雨林文化区、雨林群落区、中心瀑布区和河谷雨林区七大主题景区，演绎了神秘的热带雨林世界。高耸云天的望天树、满腹毒汁的见血封喉、突降暴雨的雨树、载人如舟的王莲、酸尽甘来的神秘果、吐雾吞烟的吐烟花、粗壮神奇的面包树、饱含柴油的油楠、暗藏杀机的茅膏菜，济济一堂；绚丽的空中花园。

由棕榈园和孑遗植物区两个半岛及人工湖组成，整个景观自然和谐，令人心旷神怡。连绵的水松、落羽杉依水而生，形成一道美妙的曲线。一边是四季碧绿的棕榈植物，椰风葵林一片热带风情；另一边是四季分明的落羽杉，春来嫩绿、入夏青葱、秋时棕红、冬来飘落，一片温带景象，宛如一幅变幻的风景图。1986年，龙洞琪林被评为“羊城八景”之一，并由此成为华南植物园具代表性的景点。

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